Когда-то Пейна звали Нагато - он был сиротой из деревни Скрытого Дождя. В детстве он познакомился с еще двумя сиротами - Конан и Яхико. Нагато нравилась идея его друга улучшить мир и привнести в него справедливость. Во время войны ребята встретились с саннинами, возвращавшихся с поля боя. Дзирайа решил позаботиться о детях и стал их учителем. Он был крайне удивлен, узнав, что Нагато обладает Риннеганом - мощнейшей техников взгляда. Однажды Нагато и Яхико столкнулись со странствующими ниндзя Скалы. Когда противники победили Яхико, Нагато превратился в берсерка и уничтожил их. В ужасе от случившегося, будущий Пейн решил стать как можно сильнее для того чтобы иметь возможность защитить себя и своих друзей. Спустя три года ребята стали достаточно сильны, чтобы одолеть одного из клонов Дзирайи. Тогда саннин принял решение прекратить тренировки, и попрощался с Нагато, Яхико и Конан.

В последующие годы трио вместе прошло через многие сражения. Нагато продолжал совершенствовать свои навыки ниндзя и силу Риннегана. Через некоторое время он взял себе новое имя - "Пейн” и начал объединять вокруг себя недовольных ниндзя Дождя. Позже Пейн начал гражданскую войну и, хотя противников вел легендарный ниндзя Саншуу Ханзо, Пейн смог его победить. Однако он на этом не остановился, уничтожив семью, друзей и деловых партнеров Ханзо, чтобы навсегда стереть его имя. Хотя у Пейна было много последователей, большинство из них никогда не видело своего лидера в лицо. О его бессердечности, способностях и внешности ходило множество слухов. Некоторые даже стали почитать Пейна как бога. Известно, что приказы Пейн отдает из высокой башни в Стране Дождя. В этой же башне находится секретная комната с пятью таинственными телами, одетыми в форму Акацки.

За несколько лет до начала повествования Пейн вместе с Конан вступили в Акацки. Девушка - одна из немногих людей, знакомая с его прошлым. Ей довелось увидеть множество битв, в которых участвовал Пейн, и Конан уверена что он не проиграл ни одной. Пейн способен контролировать дождь в окружающей местности и с его помощью легко узнает о приближении противников.
Пейн ведет себя как лидер группы, хотя известно что он и Конан отчитывались перед Тоби. Он уверен, что группа сможет достичь своих целей когда наконец-то завладеет всеми Демонами. Кроме того Пейн призывает гигантскую статую Короля Ада, в которой запечатаны уже захваченные организацией Демоны. Пейн уравновешенный и хладнокровный ниндзя, не допускающий конфликтов в своем отряде. Говорят, что он не проиграл ни одного боя в своей жизни.

Глаза Пейна:

Ренинган – наследная черта отшельника Рокюдо и его потомков. Отшельник Рокюдо считается первым шиноби и среди трех основных доуджутсу,его способность считается самой могущественной. Он является изобретателем большинства видов нинджутсу. Риннеган мог служить целям и созидания и разрушения. Считается, что нинзя, обладающий Риннеганом может использовать все доступные разновидности техник (имеется ввиду техник огня, воды, ветра, земли и молнии).
Истинное могущество Риннегана в настоящее время неизвестно. Сирота из деревни Дождя Нагато, являющийся наследником этого Доуджутсу, использовал Риннеган подсознательно, когда был испуган или если ему угрожала опасность. Он впадал в бешенство, что позволяло ему побеждать намного более сильных своих противников. Нагато, известный как Пейн, является лидером Акацуки, а также входит в группу мятежников деревни Дождя. С помощью Риннегана он может перемещать свой разум в другие тела, что делает его практически неуязвимым